بررسی ساختار و خواص بیوشیمیایی و شیمی فیزیکی کورکومینوئیدها و برهم کنش های آن ها با ماکرومولکول های زیستی و نانوتیوب ها با استفاده از روش های شیمی محاسباتی

در این کار پژوهشی، ابتدا خواص الکترونی و ساختاری ایزومرهای مختلف کورکومین و چند ساختار مشابه آن بطور محاسباتی با استفاده از تئوری تابعی چگالی مورد مطالعه قرار گرفت. سپس با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی، کمپلکس های تشکیل شده از این دارو با چند حامل مطالعه گردید. نتایج این مطالعات که شامل ساختار بهینه شده مولکول های مورد نظر، میزان فعالیت و واکنش پذیری آنها می باشد مورد بررسی قرار گرفته و باهم مقایسه شد. در مرحله بعد راهکارهای ارائه شده برای افزایش فراهمی زیستی کورکومین بصورت محاسباتی مطالعه و از میان حامل های مختلف، آلبومین و نانولوله کربن تک دیواره انتخاب و مورد بررسی قرار گرفت. برهم کنش ساختارهای مورد مطالعه با آلبومین با استفاده از روش داکینگ مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی مورد بررسی قرار گرفته و اسید آمینه های درگیر در این برهم کنش مشخص شدند. تاثیر حضور نانولوله بر آرایش کورکومین ها در آب مورد بررسی قرار گرفت. کورکومین ها بعلت حلالیت خیلی پایین در آب ، در کنار یکدیگر تجمع می یابند. نتایج شبیه سازی دینامیک مولکولی سیستم های شامل کورکومین- نانولوله – آب نشان داد که در حضور نانولوله، تجمع کورکومین ها در آب حذف و تجمع قویتر کورکومین- نانولوله تشکیل می شود. کورکومین یکی از عوامل ضدسرطان و تنظیم کننده پروتئین کیناز c می باشد. در مرحله آخر این پژوهش، با استفاده از روش های داکینگ مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی، این تنظیم کنندگی pkc توسط ایزومرهای مختلف کورکومین و چند ساختار مشابه آن، مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان می دهد که گروههای عاملی کورکومین، فاکتور مهم در میان کنش این ساختارها با پروتئین می باشند.